Arsenolit kết tinh giống như senarmontit trong hệ tinh thể lập phương trong nhóm không gian Fd3m (nhóm không gian số 227) với kích thước lưới a = 11,07 Å và 16 đơn vị công thức trên một ô đơn vị[5]

Cấu trúc tinh thể của arsenolit bao gồm 4 chóp tam diện phẳng AsO3 với nguyên tử asen ở đỉnh. Các hình chóp này được liên kết nhờ các nguyên tử oxy chia sẻ chung để tạo thành các phân tử As4O6, được giữ cùng nhau bởi lực Van der Waals.